生态工程学院是学校的主要教学单位之一，自1987年开设环境监测专业以来，已有38年的办学历史和办学经验，主要培养市政工程类、水利环境类和园林施工管理类的高技术人才。现开设环境工程技术、市政工程技术、水利工程、园林工程技术等四个专业。其中，环境监测与治理技术专业是2010年的江苏省品牌专业，园林工程技术专业是江苏省“十二五”高等学校重点建设专业。现有在校学生近800人。

学院积极弘扬教育家精神、企业家精神、工匠精神，拥有较强的师资队伍。现有专业教师29人，其中教授、正高级工程师5人，副教授、高级工程师11人，博士后2人，博士8人，硕士14人。专任教师中有江苏省“333工程”培养对象3人，江苏省高校“青蓝工程”中青年学术带头人、优秀青年骨干教师5人，江苏工匠1人，江苏省五一劳动奖章1人。近五年，教师获得市厅级及以上各类荣誉16项。

学院积极推进教育教学改革和科技创新服务，已经取得了较为丰硕的实践成果。在学校创建“全国一流智能建造特色鲜明的职教本科院校”的目标引领下，坚持办学能力高水平、产教融合高质量，牵头成立“全国智慧水务产教融合共同体”，获江苏省职业教育水生态低碳修复技艺技能传承创新平台1项，建设“十四五”职业教育国家规划教材3部，完成市厅级及以上教科研课题30余项，获市厅级及以上教科研奖项16项。服务“一带一路”倡议，深度参与国际产能合作，助力中资企业海外发展，承担“坦桑尼亚国家新能源工程技术员（水力）6级职业技能岗位标准开发”等项目，提升职业教育国际影响力。

学院教学设施齐全，实验实训条件良好。建成有化学分析实验室、环境工程微生物实验室、水处理工程实训室、环境监测实训室、水力学实验室、土力学实验室及智能监测实验室等21个校内实验实训场所。深入推进现代学徒制人才培养改革，与江苏雨发集团有限公司、众业建设集团有限公司等知名企业深度合作，建立校外实习实训基地20余个，为学生实践教学和创新创业提供了良好的成长环境。

面向国家“双碳”目标和绿色低碳环保产业领域“智改数转”的转型升级战略，学院坚持以职教本科创建为契机，深化企事业单位全过程参与人才培养，促进专业设置对接产业发展、人才培养对接职业岗位、课程内容对接职业标准、教学过程对接生产过程、学历证书对接职业证书、职业教育对接终身学习，注重学生实际工作能力培养，毕业生深受到中建八局、中核华兴建设公司、中电二公司等用人单位的肯定和好评。近五年，学生顶岗实习期间均能带薪上岗，就业率均高达96％以上。